Analysetools zur Bearbeitung komplexer Datensätzen
Die Abteilung Funktionelle Genomforschung kombiniert für die Analyse von verschiedenen Krankheitsbildern unterschiedliche OMICs Technologien, die in der Regel eine hohe Komplexität besitzen.
Zu diesem Zweck wurden spezielle Auswertetools entwickelt bzw. angepasst, die über folgenden Links aufgerufen werden können:
Fuchs, S., Mehlan, H., Bernhardt, J., Hennig, A., Michalik, S., Surmann, K., Pané-Farré, J., Giese, A., Weiss, S., Backert, L., Herbig, A., Nieselt, K., Hecker, M., Völker, U., & Mäder, U. (2018). AureoWiki ̵ The repository of the Staphylococcus aureus research and annotation community. International Journal of Medical Microbiology : IJMM, 308(6), 558–568. doi.org/10.1016/j.ijmm.2017.11.011
Meyer, T. C., Schmidt, F., Steinke, J., Bröker, B. M., Völker, U., & Michalik, S. (2020). Technical report: xMAPr - High-dynamic-range (HDR) quantification of antigen-specific antibody binding. Journal of Proteomics, 212, 103577. https://doi.org/10.1016/j.jprot.2019.103577
Reder, A., Hentschker, C., Steil, L., Gesell Salazar, M., Hammer, E., Dhople, V. M., Sura, T., Lissner, U., Wolfgramm, H., Dittmar, D., Harms, M., Surmann, K., Völker, U., & Michalik, S. (2024). MassSpecPreppy-An end-to-end solution for automated protein concentration determination and flexible sample digestion for proteomics applications. Proteomics, 24(9), e2300294. doi.org/10.1002/pmic.202300294